国际上首个橡胶草高密度SNP遗传图谱构建

橡胶草又称俄罗斯蒲公英，其根部橡胶含量高，品质优良，是近年来备受关注的重要产胶作物之一。目前，我国橡胶草种质较少且橡胶草种质的含胶量普遍较低，不能满足橡胶草产业化发展要求。因此，筛选和创制高含胶量橡胶草是目前主要的育种目标。

近日，中国热带农业科学院橡胶研究所（以下简称中国热科院橡胶所）在橡胶草遗传图谱构建和含胶量QTL发掘方面取得重要进展，通过全基因组重测序技术构建了国际上首个橡胶草高密度SNP（单核苷酸多态性）遗传图谱，并结合作图群体的含胶量数据，定位了6个含胶量相关QTL（数量性状位点）。该研究为橡胶草含胶量相关分子标记的开发、分子标记辅助育种和功能基因图位克隆提供了信息基础和技术支持。相关研究成果发表于BMC Genomics。

研究团队以两个含胶量差异大的橡胶草株系杂交构建的F1代群体作为作图群体，利用“双假测交”策略采用全基因组重测序技术开发SNP标记，基于橡胶草染色体水平上的全基因组信息，成功构建国内外第一个橡胶草高密度SNP遗传图谱。该遗传图谱由12680个bin构建的9个连锁群组成，包含322,439个SNP。遗传图谱的总遗传距离为34,220.75 cM，平均遗传距离2.70 cM。结合 F1代作图群体的含胶量数据，利用复合区间作图法共检测到6个含胶量相关QTL。其中，在 LG06/ChrA06 （第6号连锁群/第6号染色体）上，具有2个最高LOD （Logarithm of odds）值的QTL彼此接近，解释了表型贡献率的48.27%，表明其可能是影响橡胶草含胶量的主要区域，并对该区域包含的基因也进行了初步分析。

中国热科院橡胶所副研究员杨玉双为论文第一作者，研究员刘实忠为论文通讯作者。该项研究得到国家自然科学基金和所基本科研业务费等项目资助。